该技术结合正、反遗传学方法，在活体斑马鱼上研究基因的功能。 运用共聚焦或双光子显微镜，在清醒斑马鱼上长时间观察特定基因对细胞、器官或组织形态发育以及肿瘤发生和迁移的影响。首先将斑马鱼幼鱼在清醒状态下用琼脂糖固定在记录槽中，然后将标本移至显微镜下，找到目标（如表达GFP或RFP的细胞）后，对其细微结构（如神经元的突起、血管上皮细胞的生长椎等）或整体形态（例如心脏、肿瘤等）进行连续几天的三维重构观察和分析。
